אנשים רבים עשויים לבלבל בין מאווררי זרימה צירית לבין מאווררים צנטריפוגליים, אך למעשה יש להם הבדלים משמעותיים במבנה ובתפקוד:
(1) כיוון זרימת האוויר: כיוון זרימת האוויר של מאוורר זרימה צירית מקביל לציר הסיבוב, בעוד שכיוון זרימת האוויר של מאוורר צנטריפוגלי מאונך לציר הסיבוב.
(2) לחץ אוויר ונפח אוויר: למאווררי זרימה צירית יש נפח אוויר גדול יותר אך לחץ אוויר נמוך יותר; למאווררים צנטריפוגליים יש לחץ אוויר גבוה יותר אך נפח אוויר קטן יותר.
(3) תרחישים ישימים: מאווררי זרימה צירית מתאימים ליישומים הדורשים זרימת אוויר גבוהה, בעוד שמאווררים צנטריפוגליים מתאימים יותר ליישומים הדורשים לחץ אוויר גבוה, כגון מערכות מיזוג אוויר.
